Das Inselspital ist Teil der Insel Gruppe und somit der Direktion Insel Gruppe unterstellt. Diese setzt sich zusammen aus sechs Direktoren, zwei Direktorinnen sowie dem Direktionspräsidenten. Die Erweiterte Direktion Insel Gruppe ist ein Informations- und Entscheidgremium. Sie berät und unterstützt die Direktion Insel Gruppe bei Themen, welche das Kerngeschäft betreffen. Dabei fördert sie die interdisziplinäre, medizinbereichsübergreifende Zusammenarbeit.

• Direktion Medizin
• Direktion Pflege
• Direktion Lehre und Forschung
• Direktion Management Services
• Direktion Personal
• Direktion Technologie und Innovation
• Direktion Immobilien und Betrieb

Der Direktionspräsident verfügt über einen Stab. Die Direktionen und der Stab haben in ihrem Fachgebiet Weisungskompetenzen sowohl gegenüber anderen Direktionen, wie auch gegenüber den Medizinbereichen.

Die Kliniken, Institute und Standorte sind in Medizinbereichen verortet. Diese sind für die qualitativ hochstehende klinische Dienstleistung verantwortlich. Dazu stellen die Kliniken und Institute ihre Fachexpertise zur Verfügung und betreiben Lehre und Forschung (exkl. Pflege- und Therapieforschung). Die Aus- und Weiterbildung der Pflege / MTT sowie die Pflege- und Therapieforschung wird durch die Medizinbereiche wahrgenommen.